武汉大学长江文明考古研究院成立于2020年12月29日，是全面贯彻落实习近平总书记关于考古学讲话精神的具体行动，是在国家“十四五”规划和2035远景目标指导下的探索实践，也是响应新时代全面推进“新文科”建设、实现高等教育内涵式发展的主动作为。

研究院由武汉大学与湖北省文化和旅游厅共建，在双方组成的理事会指导下具体开展建设工作。樊锦诗任名誉院长、冯天瑜任学术委员会主任，刘礼堂任院长，余西云任常务副院长。研究院重点打造“四个一流”：打造一流的考古文博人才培养体系、建设一流的考古文博学科群落、推进一流的考古文博科学研究、实现一流的考古文化遗产展示与利用。

研究院设立七个研究中心（所），包括：武汉大学科技考古研究中心（主任张建民，副主任，常务副主任余西云，副主任潘春旭、李涛）、武汉大学简帛研究中心（主任陈伟，副主任李天虹）、武汉大学历史地理研究所（所长郑威）、武汉大学青铜文明研究中心（主任张昌平）、武汉大学“一带一路”考古研究中心（主任李英华）、武汉大学茶文化研究中心（主任刘礼堂，副主任宋时磊）、武汉大学文化遗产与数字化保护研究中心（主任王晓光，副主任王炎松、黄先锋、宋海超、徐雷）。

长江文明考古研究院的学科依托是武汉大学考古学科。该学科成立于1976年，是中国较早成立的考古学科之一，是湖北省乃至中南地区唯一的考古学科，经过四十多年的发展，已形成了较完整的学科体系、较高水平的人才队伍和若干优势特色研究领域，具有一流的学术水准和广泛的国际影响力。